اصل 110 قانون اساسي ،چهار وظيفه ي مهمّ دررابطه با كلّ نظام جمهوري اسلامي ايران را برعهده رهبر گذاشته است:1- تعيين سياست هاي كلّي نظام جمهوري اسلامي ايران پس ازمشورت با مجمع تشخيص مصلحت نظام؛2- نظارت برحُسن اجراي سياست هاي كلّي نظام؛3- حلّ اختلاف وتنظيم روابط قواي سه گانه؛4- حلّ معضلات نظام كه ازطريق عادي قابل حلّ نيست، ازطريق مجمع تشخيص مصلحت نظام؛
وظايف واختيارات رهبر نسبت به قواي سه گانه
1- قوّه ي مجريه
قواي نظامي وانتظامي دربيشتر كشورهاي دنيا بخشي ازقوّه مجريه اند وطبق اصل 113 قانون اساسي جمهوري اسلامي ايران نيز پس ازمقام رهبري، رييس جمهور بالاترين مقام رسمي كشور است ورياست قوّه مجريه نيز به عهده ي اوست. امّا درهمين اصل ياد آوري شده است كه رييس جمهور دربخشي ازقوّه مجريه ، كه رهبري آن را به طور مستقيم اداره و هدايت مي كند، وظيفه واختياري ندارد. از جمله اين موارد نيروهاي نظامي وانتظامي است. پس براساس اصل 110 ، 130، 131 قانون اساسي ، اختيارات رهبري درقوّه ي مجريه عبارت اند از:1- فرماندهي كلّ نيروهاي مسلّح؛2- اعلان جنگ وصلح وبسيج نيروها؛3- نصب وعزل وقبول استعفاي فرمانده ي كلّ ورييس ستاد مشترك ارتش؛4- نصب وعزل وقبول استعفاي فرمانده ي كلّ سپاه پاسداران انقلاب اسلامي؛5- نصب وعزل وقبول استعفاي فرماندهان عالي نيروهاي نظامي وانتظامي؛ 6- امضاي حكم رياست جمهوري پس ازانتخاب ازطريق رأي مردم؛7- عزل رييس جمهور پس ازرأي عدم كفايت مجلس شوراي اسلامي ويا احراز تخلّف رياست جمهوري از وظايف قانوني خود براساس نظر ديوان عالي كشور؛8- تأييد مصوّبات شوراي عالي امنيّت ملي؛9- قبول استعفاي رييس جمهور؛10- محول كردن مسؤوليت هاي رييس جمهور به معاون اوّل رييس جمهوري در شرايط خاصّ؛ مانند فوت، استعفا، بيماري طولاني رييس جمهور ومانند آن.
2. قوّه مقنّنه
اختيارات و وظايف رهبري درقوّه مقنّنه به قرار زير است:1- فرمان اجراي همه پرسي: طبق اصل 59 قانون اساسي، درمسايل بسيار مهمّ اقتصادي، سياسي، اجتماعي وفرهنگي ممكن است اعمال قوّه مقنّنه از راه همه پرسي و مراجعه ي مستقيم به آراي مردم صورت گيرد و درخواست مراجعه به آراي عمومي هم بايد به تصويب دو سوّم مجموع نمايندگان مجلس برسد. هم چنين طبق بند سوّم اصل 110 قانون اساسي، فرمان همه پرسي جزو وظايف و اختيارات رهبر است. از اين دو اصل چنين استنباط مي شود كه پس از تصويب دو سوّم نمايندگان، همه پرسي درصورتي اجرا مي شود، كه فرمان اجراي آن را رهبري صادر كند.2- نصب ، عزل وقبول استعفاي فقهاي شوراي نگهبان: طبق اصول91 و92 قانون اساسي، انتخاب ، عزل وقبول استعفاي فقها با مقام رهبري است.
3. قوّه قضاييّه